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| 基于网络药理学和生物信息学补肾活血胶囊抗骨质疏松的分子机制分析 |
| Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍｅｃｈａｎｉｓｍ ｏｆ ｎｏｕｒｉｓｈｉｎｇ ｋｉｄｎｅｙ ａｎｄ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｂｌｏｏｄ ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ ｃａｐｓｕｌｅ ｉｎ ｔｈｅｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｏｓｔｅｏｐｏｒｏｓｉｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｎｅｔｗｏｒｋ ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ |
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| DOI：10.3969/j.issn.1006-7108.2018.06.011 |
| 中文关键词: 补肾活血胶囊 骨质疏松症 网络药理学 生物信息学 分子机制 |
| 英文关键词:Ｎｏｕｒｉｓｈｉｎｇ ｋｉｄｎｅｙ ａｎｄ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｂｌｏｏｄ ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ ｃａｐｓｕｌｅ Ｏｓｔｅｏｐｏｒｏｓｉｓ Ｎｅｔｗｏｒｋ ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ |
| 基金项目:国家自然科学基金（８１３７３６６０，８１７７４３３３）；山东省重点研发计划（２０１６ＧＳＦ２０２０２２） |
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| 中文摘要: |
| 目的 基于网络药理学和生物信息学挖掘补肾活血胶囊的活性成分靶点和骨质疏松症的靶点，探究补肾活血胶囊抗
骨质疏松的分子机制。方法 通过采用网络药理学和生物信息学的相关手段，对补肾活血胶囊进行活性成分筛选、药物疾病
靶点预测，明确补肾活血胶囊防治骨质疏松症的特异性靶点，分析其信号通路富集程度以探究其分子机制。结果 通过
ＴＣＭＳＰ 数据库检索共发现补肾活血胶囊相应成分１１８６ 个，根据ＯＢ 值和ＤＬ 值筛选出入血活性成分２４９ 个，在此基础上获得
其预测靶点１４５ 个。通过二次挖掘ＧＥＯ 数据库的基因芯片筛选出明显的差异基因１２４ 个；检索疾病基因相关数据库共发现
与骨质疏松症发生发展相关的已知的靶点基因３５６ 个。通过ｃｙｔｏｓｃａｐｅ 构建并结合网络拓扑分析共筛选出关键基因２２９ 个；
利用ＣｌｕｅＧＯ 富集分析显示，补肾活血胶囊除与直接作用于骨质疏松症关键节点涉及的信号通路，如Ｗｎｔ 信号通路、ＴＧＦ?β 信
号通路和Ｎｏｔｃｈ 信号通路等有关，还对Ｐ１３ Ｋ?ＡＫＴ 信号通路、ＶＥＧＦ 信号通路和甲状腺素信号通路等同时进行调控。结论
补肾活血胶囊治疗骨质疏松症具有多成分、多靶点的特点；其主要通路不仅直接参与骨重建的细胞分化，调节成骨、破骨代谢
平衡，还通过全身其他系统，如循环系统、神经系统等来干预和影响骨微环境，与目前抗骨质疏松的作用机制相符合。 |
| 英文摘要: |
| Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ Ｔｏ ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅ ｔｈｅ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍｅｃｈａｎｉｓｍ ｏｆ ｎｏｕｒｉｓｈｉｎｇ ｋｉｄｎｅｙ ａｎｄ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｂｌｏｏｄ ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ ｃａｐｓｕｌｅ ａｎｄ
ｉｔｓ ｐｒｅｄｉｃｔｉｖｅ ａｎｄ ｋｅｙ ｔａｒｇｅｔｓ ｏｎ ｔｈｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｏｓｔｅｏｐｏｒｏｓｉｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｎｅｔｗｏｒｋ ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ． Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｔｈｅ
ｍｅｔｈｏｄ ｏｆ ｎｅｔｗｏｒｋ ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ｗａｓ ｕｓｅｄ ｔｏ ｄｅｔｅｒｍｉｎｅ ａｎｄ ｔｏ ｓｃｒｅｅｎ ｔｈｅ ｋｎｏｗｎ ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇ ｔｏ
ｎｏｕｒｉｓｈｉｎｇ ｋｉｄｎｅｙ ａｎｄ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｂｌｏｏｄ ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ ｃａｐｓｕｌｅ， ｔｏ ｐｒｅｄｉｃｔ ｔｈｅ ｄｒｕｇ?ｒｅｌａｔｅｄ ｇｅｎｅ ／ ｐｒｏｔｅｉｎ ｔａｒｇｅｔｓ， ｔｏ ａｎａｌｙｚｅ ｔｈｅ ｓｉｇｎａｌ
ｐａｔｈｗａｙ ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ， ａｎｄ ｔｏ ｆｕｒｔｈｅｒ ａｎａｌｙｚｅ ｔｈｅ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍｅｃｈａｎｉｓｍ ｏｆ ｎｏｕｒｉｓｈｉｎｇ ｋｉｄｎｅｙ ａｎｄ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｂｌｏｏｄ ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ ｃａｐｓｕｌｅ．
Ｒｅｓｕｌｔｓ １１８６ ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇ ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ ｏｆ ｎｏｕｒｉｓｈｉｎｇ ｋｉｄｎｅｙ ａｎｄ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｂｌｏｏｄ ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ ｃａｐｓｕｌｅ ｗｅｒｅ ｒｅｔｒｉｅｖｅｄ ｆｒｏｍ ｔｈｅ
ＴＣＭＩＤ ｄａｔａｂａｓｅ． Ａｃｃｏｒｄｉｎｇ ｔｏ ｔｈｅ ｖａｌｕｅｓ ｏｆ ＯＢ ａｎｄ ＤＬ， ２４９ ｂｌｏｏｄ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓ ｗｅｒｅ ｓｃｒｅｅｎｅｄ， ａｎｄ １４５ ｐｒｅｄｉｃｔｉｎｇ
ｔａｒｇｅｔｓ ｗｅｒｅ ｏｂｔａｉｎｅｄ． Ｔｈｒｏｕｇｈ ｔｈｅ ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｍｉｎｉｎｇ ｏｆ ｔｈｅ ｇｅｎｅ ｃｈｉｐ ｏｆ ＧＥＯ ｃｈｉｐ ｄａｔａｂａｓｅ， １２４ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｇｅｎｅｓ ｗｅｒｅ
ｏｂｔａｉｎｅｄ． Ａ ｔｏｔａｌ ｏｆ ３５６ ｋｎｏｗｎ ｔａｒｇｅｔ ｇｅｎｅｓ ｃｌｏｓｅｌｙ ｒｅｌａｔｅｄ ｔｏ ｔｈｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ｏｓｔｅｏｐｏｒｏｓｉｓ ｗｅｒｅ ｒｅｔｒｉｅｖｅｄ ｆｒｏｍ ｔｈｅ ｄｉｓｅａｓｅ?ｒｅｌａｔｅｄ
ｄａｔａｂａｓｅ． Ｕｓｉｎｇ ｔｈｅ ｃｙｔｏｓｃａｐｅ ｔｏ ｃｏｎｓｔｒｕｃｔ ａｎｄ ｓｙｎｔｈｅｓｉｚｅ ｔｈｅ ｐｒｏｔｅｉｎ?ｐｒｏｔｅｉｎ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ ｎｅｔｗｏｒｋ ｏｆ ａｃｔｉｖｅ ｉｎｇｒｅｄｉｅｎｔｓ ａｎｄ ｄｉｓｅａｓｅｓ，
２２９ ｋｅｙ ｇｅｎｅｓ ｗｅｒｅ ｓｃｒｅｅｎｅｄ ｏｕｔ ｂｙ ｎｅｔｗｏｒｋ ｔｏｐｏｌｏｇｉｃａｌ ａｎａｌｙｓｉｓ． Ｕｓｉｎｇ ＣｌｕｅＧＯ ａｎａｌｙｓｉｓ， ｉｔ ｉｓ ｓｈｏｗｎ ｔｈａｔ ｎｏｕｒｉｓｈｉｎｇ ｋｉｄｎｅｙ ａｎｄ
ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｂｌｏｏｄ ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ ｃａｐｓｕｌｅ ｗａｓ ｄｉｒｅｃｔｌｙ ｉｎｖｏｌｖｅｄ ｉｎ ｔｈｅ ｓｉｇｎａｌ ｐａｔｈｗａｙｓ ｏｆ ｔｈｅ ｋｅｙ ｐｏｉｎｔｓ ｏｆ ｏｓｔｅｏｐｏｒｏｓｉｓ， ｗｈｉｃｈ ｗｅｒｅ
ｍａｉｎｌｙ ｒｅｌａｔｅｄ ｔｏ ｔｈｅ ｄｉｒｅｃｔ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ ｂｏｎｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ， ｓｕｃｈ ａｓ Ｗｎｔ ｓｉｇｎａｌｉｎｇ ｐａｔｈｗａｙ， ＴＧＦ? ｓｉｇｎａｌｉｎｇ ｐａｔｈｗａｙ， Ｎｏｔｃｈ
ｓｉｇｎａｌｉｎｇ ｐａｔｈｗａｙ， Ｐ１３ Ｋ?ＡＫＴ ｓｉｇｎａｌｉｎｇ ｐａｔｈｗａｙ， ＶＥＧＦ ｓｉｇｎａｌｉｎｇ ｐａｔｈｗａｙ， ａｎｄ ｔｈｙｒｏｉｄ ｈｏｒｍｏｎｅ ｓｉｇｎａｌｉｎｇ ｐａｔｈｗａｙ． Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ
Ｎｏｕｒｉｓｈｉｎｇ ｋｉｄｎｅｙ ａｎｄ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｂｌｏｏｄ ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ ｃａｐｓｕｌｅ ｈａｓ ｔｈｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｔａｒｇｅｔｓ ａｎｄ ｍｕｌｔｉｃｏｍｐｏｎｅｎｔ ｉｎ ｔｈｅｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｏｓｔｅｏｐｏｒｏｓｉｓ． Ｉｔ ｉｓ ｎｏｔ ｏｎｌｙ ｄｉｒｅｃｔｌｙ ｉｎｖｏｌｖｅｄ ｉｎ ｂｏｎｅ ｃｅｌｌ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ ａｎｄ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｂａｌａｎｃｅ ｏｆ ｏｓｔｅｏｇｅｎｅｓｉｓ ａｎｄ
ｏｓｔｅｏｃｌａｓｔｓ， ｂｕｔ ａｌｓｏ ａｆｆｅｃｔｓ ａｎｄ ｉｎｔｅｒｆｅｒｅｓ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ｂｏｎｅ ｍｉｃｒｏｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ ｔｈｒｏｕｇｈ ｏｔｈｅｒ ｓｙｓｔｅｍｉｃ ｓｙｓｔｅｍｓ， ｓｕｃｈ ａｓ ｃｉｒｃｕｌａｔｏｒｙ
ｓｙｓｔｅｍ， ｎｅｒｖｏｕｓ ｓｙｓｔｅｍ， ｗｈｉｃｈ ｉｓ ｃｏｎｓｉｓｔｅｎｔ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ｃｕｒｒｅｎｔ ｍｅｃｈａｎｉｓｍ ｏｆ ｏｓｔｅｏｐｏｒｏｓｉｓ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ． |
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